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逆转录酶带RNase H活性和不带活性,对后续qPCR影响大吗?

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提问:老王同学 2026-08-08 浏览 246 4 个回答
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潘
潘阿宝 2026-09-12
用同一份真菌RNA分别做M-MLV H minus和AMV反转录,qPCR看内参Ct和扩增曲线,普通PCR看产物长度。重点看高GC目标基因能否稳定扩增,不要只看总cDNA产量。10000U做梯度对比足够,建议同时设无逆转录对照,排除基因组DNA污染。
L
LabZone 2026-09-11
AMV反应温度通常在42—60℃,确实有助于打开高GC模板的二级结构,但它的RNase H活性通常较强。真菌RNA GC偏高,如果只做短片段qPCR,AMV可能可以接受,但高温长时间反转录也可能加剧RNA降解。建议先小规模比较Ct值和产物。
F
Flask5368 2026-09-19
高GC模板无论选哪种酶,反转录前65—70℃变性5min并立即冰浴通常能改善可及性。如果AMV高温条件下Ct仍高,可尝试M-MLV H minus并用甜菜碱或DMSO辅助。抑制剂浓度需要梯度验证,避免影响后续qPCR效率。
L
Lab6607 2026-09-16
RNase H会降解RNA:DNA杂交链中的RNA,对cDNA产量和长片段完整性影响更明显。qPCR通常用短扩增子,有时Ct值差异不大,但若后续要建cDNA文库或扩增长片段,建议优先选RNase H minus的M-MLV,减少模板完整性损失带来的不确定性。
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