Applications去腐殖酸再突破|增强版土壤DNA提取,适配多类型样本
随着微生物组学研究飞速发展,16S rRNA 基因测序、宏基因组测序已成为生态环境、农业科研、肠道微生态、食品安全及环境监测领域的核心研究手段。16S rRNA 测序主要针对细菌古菌保守区进行扩增测序,操作便捷、成本适中,广泛用于微生物群落多样性分析、物种组成鉴定、菌群结构差异比对、环境与肠道菌群溯源,是科研实验室常规微生物群落分析的主流技术。source:
随着微生物组学研究飞速发展,16S rRNA 基因测序、宏基因组测序已成为生态环境、农业科研、肠道微生态、食品安全及环境监测领域的核心研究手段。
16S rRNA 测序主要针对细菌古菌保守区进行扩增测序,操作便捷、成本适中,广泛用于微生物群落多样性分析、物种组成鉴定、菌群结构差异比对、环境与肠道菌群溯源,是科研实验室常规微生物群落分析的主流技术。

source:Blaser 2016
宏基因组测序可直接对样本中全部微生物总 DNA 进行高通量测序,可深度解析物种组成、基因功能、代谢通路、菌株基因组信息,在土壤生态功能挖掘、复杂基质未知微生物鉴定、病原筛查、发酵机理研究等高端科研中应用愈发广泛。
无论是 16S 扩增测序还是宏基因组高通量测序,前提都依赖高质量、高纯度、无抑制物、完整性好的样本总 DNA。而土壤、粪便、有机肥、发酵物料等均属于高有机质、高杂质、高抑制物复杂基质,极易出现 DNA 得率低、降解严重、腐殖酸 / 多糖 / 多酚残留高、PCR 扩增受阻、测序数据质量差等问题,直接影响后续菌群分析与基因功能解析结果。
为从源头解决复杂样本核酸提取痛点,助力16S 测序、宏基因组测序及各类分子实验稳定开展,翌圣生物重磅推出增强版土壤DNA 提取试剂盒。全新优化裂解体系、强力除杂配方与特异性吸附纯化工艺,相较普通版本除抑制物能力更强、裂解更彻底、DNA 完整性更高、纯度与得率双重升级。产品不仅针对各类复杂土壤做了专项性能优化,更实现跨场景多样本通用,一盒即可满足环境、肠道菌群、农业、发酵全品类样本DNA 提取需求。

本试剂盒不局限于常规土壤样本,同时完美兼容:粪便样本、有机肥料样本、肠道内容物样本、发酵产物样本、环境拭子样本、水体滤膜样本,各样本细分应用场景专业全覆盖
1. 各类土壤样本
适配农田土、林地土、盐碱土、湿地淤泥、果园土、矿山土、栽培基质土、黑土、红土、黄土、沙土等。
应用:土壤微生物 16S/ITS 高通量测序、宏基因组测序、土壤病原微生物检测、土壤生态多样性调研、连作障碍微生物分析、土壤功能菌群筛选等。
2. 粪便样本
适配人源、畜禽、水产、模式动物粪便样本。
应用:肠道菌群多样性分析、宿主 - 微生物互作研究、病原微生物溯源、菌群与疾病关联研究、畜禽养殖微生态监测。
3. 肠道内容物样本
适配实验动物、畜禽肠道各段内容物。
应用:肠道原位微生物群落解析、消化代谢菌群研究、益生菌与定植机制研究、动物营养与微生态调控实验。
4. 有机肥料样本
适配商品有机肥、堆肥、秸秆腐熟肥、菌肥、农家肥等基质。
应用:肥料中功能菌种鉴定、杂菌污染检测、腐熟度微生物评估、农业农资质检标准检测。
5. 发酵产物样本
适配微生物发酵液、固态发酵基质、菌剂发酵物料、食品与工业发酵样品。
应用:发酵过程菌群动态监测、优势菌种鉴定、发酵工艺优化、杂菌污染溯源与质控。
6. 环境拭子样本
适配实验室台面、养殖环境、公共设施、畜禽圈舍、水体周边表面擦拭拭子。
应用:环境微生物污染监测、致病菌筛查、卫生安全检测、环境微生态本底调查。
7. 水体滤膜样本
适配地表水、污水、养殖水体、饮用水过滤截留滤膜样本。
应用:水体浮游微生物群落分析、水源致病菌检测、水环境生态监测、水质安全分子筛查。

专项优化除腐殖酸、多糖、多酚、发酵代谢杂质体系,高效消除 PCR 及测序扩增抑制,适配二代、三代测序严苛标准;
裂解更充分,核酸吸附回收效率高,OD260/280 比值稳定,无蛋白、多糖残留;
温和裂解工艺,有效保护基因组 DNA 完整性,适配二代测序和三代测序;
高腐殖酸的疑难杂症样本,提取产物依然纯净。
独特的过滤工艺,纯净无背景菌残留。


温育后,沉淀前的样本颜色

加PBS、沉淀液后的样本颜色
采用 18527 试剂盒对 4 份高腐殖酸黑土样本进行平行提取试验:样本 1 以 PBS 缓冲液替代专用沉淀液进行处理,结果表明,未添加沉淀液组别核酸浓度偏低、纯度不佳,且样本存在明显腐殖酸色素残留;而加入配套沉淀液后,可有效去除黑土中腐殖酸等杂质,色素残留显著降低,同时核酸得率明显提升、OD 比值更稳定,整体提取纯度与浓度均得到大幅优化。
样本 | 处理方式 | 浓度ng/μl | A260/230 | A260/280 |
1 | PBS | 45.1 | 1.34 | 0.64 |
1 | 沉淀液 | 136.05 | 1.73 | 1.65 |
2 | 沉淀液 | 125.96 | 1.68 | 1.44 |
3 | 沉淀液 | 131.83 | 1.66 | 1.42 |
4 | 沉淀液 | 118.87 | 1.67 | 1.38 |
表1 土壤DNA浓度和纯度

图1 土壤DNA琼脂糖凝胶电泳
对污泥样本分别采用18527ES 增强版土壤 DNA 提取试剂盒与supplier M、supplier J 试剂,搭配翌圣 48 通道自动化核酸提取仪进行平行提取,洗脱体积统一设置为 70 μL。结果显示:18527ES 组的核酸得率高,琼脂糖凝胶电泳条带明亮、清晰,无明显拖尾与杂带,表明其对污泥样本的核酸提取效率与完整性均更优。


图2 污泥样本DNA的浓度和电泳图

产品货号 | 规格 | 产品名称 |
18527ES08 | 8 T | |
18527ES48 | 48 T | |
18527ES96 | 96 T |
Not listed yet IMG High Sieving Agarose 高分辨率琼脂糖(PCR级)
Not listed yet IMG Agarose Tablets 琼脂糖(片剂)
Not listed yet IMG Low Melting Point Agarose 低熔点琼脂糖
Not listed yet IMG Agarose琼脂糖
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