Applications精准诊断,从逆转录开始——高效逆转录酶助力RT-qPCR
逆转录酶(Reverse Transcriptase,简称RT酶)是一种能够将RNA模板转化为互补DNA(cDNA)的酶。
逆转录酶(Reverse Transcriptase,简称RT酶)是一种能够将RNA模板转化为互补DNA(cDNA)的酶。在分子生物学研究中,逆转录酶的应用极为广泛,特别是在分子诊断领域发挥着不可或缺的作用。通过逆转录过程,可以将病毒的RNA基因组转换为cDNA,之后便可以利用如qPCR等技术对其进行扩增和检测。这一特性使得对诸如艾滋病、甲型流感以及乙型流感这类RNA病毒进行准确诊断成为可能。

图1. 逆转录流程示意图
追求更快速、更灵敏且操作更为简便的RT-qPCR分子诊断试剂已成为当前的主要发展趋势。作为RT-qPCR过程中的关键原料之一,逆转录酶需要具备更快的逆转录速度、更高的合成产量以及更好的耐热性能。为了获得更适用于RT-qPCR的逆转录酶,翌圣生物在M-MLV的基础上通过基因改造,开发出RNase H活性更低,热稳定性更高,持续合成能力更强的Hifair® 系列逆转录酶。

图2.逆转录酶作用原理图

翌圣Hifair®系列逆转录酶

目前翌圣有多种Hifair®系列逆转录酶,并且可提供各种剂型的产品,包含单酶、预混液,您可以根据实际需求进行选择。下表罗列了翌圣不同逆转录酶的特点和推荐应用。
表1.翌圣逆转录酶选择指南
产品名称(货号) | 产品特点 | 推荐应用 |
Hifair®III逆转录酶(11111ES) | 热稳定(高达65℃),适合复杂模板 | RT-LAMP |
Hifair®V逆转录酶(11300ES) | 兼容性强,速度快、合成产量高 | 一步法RT-PCR/qPCR |
Hifair® Ultra逆转录酶(14604ES) | 持续合成能力强,合成长度可达20 kb | RT-PCR/qPCR、RNA-seq、单细胞测序 |
注:以上所有的酶都有高浓度或无甘油版形式
下面重点介绍一款应用在RT-qPCR分子诊断试剂的逆转录酶:Hifair® V Reverse Transcriptase。该酶兼容性强,速度快、合成产量高,可耐受高达58℃的反应温度,非常适合用于RT-qPCR分子诊断试剂的开发。

Hifair® V逆转录酶性能展示

可耐受58℃反应温度,适合复杂RNA模板的逆转录

图3.将Hifair® V Reverse Transcriptase及进口品牌T*的逆转录酶分别在55℃及58℃下孵育30min检测残余酶活。结果显示Hifair® V Reverse Transcriptase在58℃下孵育30min仍能保持70%活性,远超进口品牌。
应用于RT-qPCR检出率优于其他品牌,检出范围:1 pg-1 μg

图4.以1 pg-1 μg(7个梯度)的293T细胞总RNA为模板,使用Hifair® V one-step RT-gDNA digestion SuperMix for qPCR(Cat#11142)、V*、T*进行逆转录,得到的cDNA进行qPCR定量分析。结果显示,11142ES灵敏度可达1 pg,检出率优于竞品。

翌圣逆转录酶突变体库

翌圣生物利用其ZymeEditor™双向分子酶理性设计与定向进化平台,持续推进逆转录酶的进化研究。至今,我们已经筛选出多种在不同应用场景下表现卓越的逆转录酶突变体,能够全面满足不同客户群体在多样化应用领域的需求。
表2.翌圣逆转录酶突变体选择指南
突变体编号 | RDDP | DDDP | Rnase H | TdT | RT产量 (低模板) | RT产量 (常规模板) | 最高反应温度(℃) |
T* IV | +++ | +++ | + | +++ | ++ | +++ | 60 |
MMLV-01 | ++ | + | + | ++++ | ++ | +++ | |
MMLV-02 | ++ | ++ | + | +++ | ++++ | ++++ | |
MMLV-03 | +++ | ++ | + | + | ++ | ++++ | 65 |
MMLV-04 | +++ | ++ | + | ++ | ++ | ++++ | 65 |
MMLV-05 | +++ | +++ | + | ++++ | +++ | ++++ | 65 |
MMLV-06 | +++ | ++ | +++ | ++ | ++ | +++ | 65 |
MMLV-07 | +++ | + | + | ++ | ++ | ++++ | 65 |
MMLV-08 | ++++ | +++ | + | +++ | +++ | ++++ | 65 |
MMLV-09 | +++ | +++ | + | +++ | ++++ | ++++ | 65 |
MMLV-10 | +++ | ++++ | + | ++++ | ++++ | ++++ | 65 |
MMLV-11 | ++ | ++ | + | +++ | ++++ | ++++ | 65 |
MMLV-12 | +++ | ++++ | + | ++++ | ++++ | ++++ | 65 |
MMLV-13 | ++ | + | + | + | + | +++ | 70 |
MMLV-14 | +++ | + | + | + | + | +++ | 70 |
MMLV-15 | ++ | + | ++ | + | + | ++ | 68 |
MMLV-16 | ++ | + | ++ | + | + | ++ | 68 |
RDDP:RNA-dependent DNA polymerase,以RNA为模板合成cDNA的活性 DDDP:DNA-dependent DNA polymerase,以DNA为模板合成DNA的活性 Rnase H:降解DNA-RNA杂交链中的RNA的活性 TdT:Terminal deoxyribonucleotidyl transferase activity,在3'末端非模板化添加脱氧核苷酸的活性 | +:极低的 ++:较低的 +++:正常的 ++++:较高的极高的 | ||||||

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