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自己定制血液肿瘤Panel,探针设计合成一般要多长时间?

供应商与采购
提问:彭辉 2026-09-07 浏览 193 3 个回答
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S
ScienceLine3707 2026-09-13
定制Panel的周期我建议按6-8周预留,不要相信4周能稳定交付。设计阶段通常要1-2周沟通BED文件、参考版本、转录本,合成和QC一般3-4周,加物流和验收很容易到6周以上。血液肿瘤80个基因若包含FLT3-ITD、KMT2A等结构复杂区域,设计修改会延长。标准品不要省,建议买Horizon、菁良等血液肿瘤参考品,用来验证SNV/indel、ITD和融合;仅靠合成商QC数据不够。合同写明设计稿确认后的交付时间和逾期条款。
生
生工新手9153 2026-09-05
设计时最容易掉覆盖的是高GC、重复序列和同源区域,血液肿瘤里像CEBPA、ASXL1、KMT2A部分外显子、FLT3-ITD附近都比较典型。建议让厂家先做探针覆盖度模拟,对低覆盖区域增加探针密度或调整设计,不要等合成完再补。100ng骨髓/外周血DNA起始量对杂交捕获够用,但要关注样本肿瘤比例,必要时加大测序深度。首版设计可以要求厂家用标准品和真实样本试测,重点看这些区域的深度和均一性,而不是只看理论覆盖。
E
Emma974 2026-09-07
补货和起订量一般按反应数算,常见48、96反应起订,首单若只想小试,可以谈测试包装但单价会高。设计存档后补货周期通常4-6周,首合成会再长1-2周,所以项目排期要留余量。建议合同里约定最小起订量、阶梯价、批间一致性测试方法,最好一次锁定2-3批分批交付,减少批次间差异。合成后要求厂家提供标准品验证数据,自己实验室再用同一批标准品复验,验收通过再进入临床项目。
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