应用方向多样本适用,细菌16S扩增子建库一站式解决方案!
16S rDNA文库建库试剂盒利用高通量测序技术对16S rDNA中V3-V4或V4区片段进行扩增,结合生物信息学技术,检测特定环境下的微生物,鉴定所检细菌种类,提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化等诸多信息。
微生物群落多样主要包括物种多样性、遗传多样性和功能多样性3个方面,在环境、能源、食品与人体健康等诸多领域有着广泛的研究与应用。16SrRNA扩增子测序技术是微生物群落多样性检测最常用的组学技术之一,该技术无需对微生物分离培养,直接提取样本里面所有微生物的基因组,利用合适的通用引物扩增16S rDNA/18S rDNA /ITS等高变区或功能基因,采用高通量测序仪Miseq、Hiseq或Novaseq对其进行测序,通过生物信息学分析可以获得特定实验样品中细菌、真菌或古菌等的物种组成、物种丰度、系统进化、群落比较等诸多信息。
16S rDNA测序
16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,具有10个保守区域和9个可变区域,其中保守区在细菌间差异不大(反映了生物物种间的亲缘关系),可变区具有属或种的特异性。对16S rDNA某个可变区进行测序,可用于研究微生物中细菌或古菌的群落结构多样性。
原核微生物的16S rRNA基因长度约为1500 bp,二代测序平台对应扩增引物一般选用V3-V4区域或V4区域,三代测序平台可选用全长扩增引物(27F/1492R)。

图1. 16S rDNA基因序列组成示意图
(蓝色为可变区,白色为保守区)
18S rDNA测序
18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。对 18S rDNA某个高变区进行测序,用于研究环境样本中真核微生物群落结构多样性。
真核微生物18S rRNA基因长度1500-2000 bp,引物一般选用V4区域。

图2. 18S rDNA基因序列组成示意图
(蓝色为可变区,白色为保守区)
ITS测序
ITS分为两个区域:ITS1和 ITS2,ITS1位于真核生物rDNA序列18S和 5.8S之间,ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1(350 bp)或ITS2(400 bp)进行测序,用于研究环境微生物中真菌群落结构多样性。
ITS区长度则为400-900 bp,引物一般选用ITS1区域。

(蓝色为可变区,白色为保守区)
宏条形码测序
目标区域扩增子测序
产品介绍
16S rDNA文库建库试剂盒利用高通量测序技术对16S rDNA中V3-V4或V4区片段进行扩增,结合生物信息学技术,检测特定环境下的微生物,鉴定所检细菌种类,提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化等诸多信息。试剂盒中包含进行细菌16S rDNA扩增的所有试剂、16S PCR扩增引物F/R,组合Illumina 和MGI平台 Index 引物试剂盒用于16S rDNA片段的扩增。

产品应用
科学研究:进行微生物群落结构和功能研究;
临床监测:用于疾病诊断、感染控制和治疗监测;
环境监测:评估环境样本中的微生物多样性和污染情况;
农业研究:研究土壤微生物群落对作物生长的影响;
能源领域:特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的开发;
食品相关监测:检测和控制食品中的微生物污染。
产品特点
适用多样本类型:兼容大多数常见环境样本,如土壤、粪便、水体、生物膜等;
高效率扩增:灵敏度低至0.1 ng,特异性优,均一性好;
测序数据质量高:低背景、高覆盖度、高均一性。
性能展示

产品信息
应用方向 | 产品名称 | 货号 |
提取试剂盒 | MolPure® Magnetic Bacterial/Fungal DNA Kit | 18565ES |
18526ES | ||
Illumina 平台细菌16S 鉴定 | 12983ES | |
16S(V4)Bacterial AmpSeq Prep Kit For Illumina | 12834ES | |
Illumina 平台细菌16S 鉴定适配的接头 | Hieff NGS® Tagment Index Kit for Illumina® | 17265ES |
MGI 平台细菌16S 鉴定 | 16S(V3-V4)Bacterial AmpSeq Prep Kit For MGI | 12833ES |
16S(V4)Bacterial AmpSeq Prep Kit For MGI | 12933ES | |
MGI 平台细菌16S 鉴定适配的接头 | Hieff NGS®Unique Dual Barcode Primer Kit for MGI® | 13350-13353ES |
16S/18S/ITS/宏条形码/功能基因多重扩增试剂 | 13283ES | |
16S 全长多重扩增试剂 | Hieff NGS®Multiplex Long PCR MasterMix | 17228ES |
双链DNA(dsDNA)定量 | 1×dsDNA HSAssay Kit/dsDNA HS Assay Kit | 12642/12640ES |
单链 DNA(ssDNA)定量 | ssDNA Assay Kit | 12645/12646ES |
DNA的纯化 | Hieff NGS® DNA Selection Beads DNA分选磁珠 | 12601ES |