我们的T7酶测试了相对保真度,与Thermo的保真度差不多,大概万分之四的突变率。目前野生型的T7保真度都差不多,基本能满足客户的需求。现项目中没有更高保真度T7的开发计划。
是通过LiCl纯化后进行测定的,我们有记录过相关数据A260/280大概比值再在2.0-2.1之间;使用我们的羧基磁珠纯化也基本在这个范围以内。具体数据可以整理之后再分享。
这一情况是T7反应体系的自身特性,无法完全避免。根据相关的文献,控制mRNA自延长的思路主要还是两方面:①对模板3'末端上游序列进行优化;②控制IVT产量,高产量下自我延伸的几率会更高
目前没有了解过是否影响计算,NanoDrop 的检测方法比较粗略,如果想要更精确的检测,可以使用Qubit检测RNA的浓度,这两种方法也是市面上比较常见的两种检测方法。
一般采用完全替代的方式,假尿苷或者 N1-甲基假尿苷的使用量与原体系尿苷的使用量一致。
mRNA体外转录模板制备方面,限制性内切酶的选择主要基于以下因素:①切口处应该是5´ 突出末端或者平末端。3´ 突出末端的存在会增加从模板体外转录(IVT)产生的假副产物;②酶切位点识别序列尽可能长;识别序列越长,该序列出现在基因片段中的可能性就越小;③IIS 型内切酶是用于疫苗开发中质粒线性化的首…
我们转录Buffer是10X的浓度,在IVT体系的终浓度是46mM,是会高于一些其他品牌。我们有做过Mg2+单因素研究的一些数据(具体不太方便公开),确定了该使用浓度。我们另外提供不含Mg2+的buffer(10669ES),方便客户自行调配Mg2+在转录体系中的终浓度,从而调节IVT产量和副产物之…
配方不同,10670ES是升级版本,我们优先推荐使用10670ES,应用场景更广,性能更好一些。
共转录要求对于模板的起始位点要求必须是 AGG* 开头两步法对于位点无要求,但我司目前产品对于AGGG起始位点的产量最高,主要是T7酶的偏好性导致。
可以在插入位点下游选择限制酶切割,切割产生平末端或 5-突出端最好。
37℃和 42℃转录能力无差别,但是不耐 50℃。
模板线性化不完全,导致转录停不下来,所以转录条带会偏大,出现杂带。
我们的T7酶测试了相对保真度,与Thermo的保真度差不多,大概万分之四的突变率。目前野生型的T7保真度都差不多,基本能满足客户的需求。现项目中没有更高保真度T7的开发计划。
是通过LiCl纯化后进行测定的,我们有记录过相关数据A260/280大概比值再在2.0-2.1之间;使用我们的羧基磁珠纯化也基本在这个范围以内。具体数据可以整理之后再分享。
这一情况是T7反应体系的自身特性,无法完全避免。根据相关的文献,控制mRNA自延长的思路主要还是两方面:①对模板3'末端上游序列进行优化;②控制IVT产量,高产量下自我延伸的几率会更高。
无核酸外切酶、切口酶、Rnase 残留残留。
体外转录后长度:1142bp;质粒模板本身长度~3700bp。
polyA 尾是设计模板时引入,加帽是单独加。
①提高NTP,帽类似物的投入量比例;②添加剂的合理应用;③反应温度可以用到40度。IVT体系优化可以从模板,T7酶的使用量,如果是共转录加帽可以考虑帽子与NTP之间的比例;酶法加帽的话,在加帽酶,2-O-甲基转移酶以及SAM的用量配比上进行条件优化。关于模板除了线性化要完全这一块,还有一点就是序列设…
20uL体系等比放大到10mL应该得率差不多的,我们一般从20uL直接放大到50mL,得率基本也在100ug/20uL的水平;我们50mL也会用离心管和金属浴的方式来测,10mL正常来说应该放大效果更好;这种情况下,一般建议酶和NTP的终浓度微调一下再试试。