本公司优化的试剂可有效降低突变假阳性率,提升文库产量,并降低嵌合reads数等,以确保实验结果的准确性与可靠性。
Coverage(基因组覆盖度)是指测序获得的序列占整个基因组的比例,反映了测序数据对基因组的覆盖程度。其解读需结合测序深度理解:(1)测序深度定义:通常以“×”表示,例如10×测序深度指平均每个基因组位置被测序reads覆盖10次,200×则为200次。(2)覆盖度与深度的关系:一般情况下,测序深…
文库产量低可能由以下原因导致:(1) DNA 质量低,样本中含抑制物(抑制酶活性等):Input DNA制备过程中带入的高浓度金属离子、螯合剂或其他盐,可能影响末端修复及A 尾添加等步骤的反应效率,。建议DNA 在TE 溶液中进行片段化,避免在无菌超纯水中操作。(2)RNA 污染:样本中存在RNA …
文库电泳时出现条带异常,主要原因及对应解决方式如下:(1)出现小片段(60-120bp):此类小片段通常为接头片段或接头形成的二聚体,可使用12601ES DNA磁珠进行纯化以去除;(2)文库富集后出现大片段:文库接头长度一般约120bp,若文库片段扩增幅度超过120bp可能是PCR扩增过度导致片段…
OnePot/OnePot II DNA 建库试剂盒针对基因组 DNA 和 cDNA 均可获得高产高质的文库。以下为具体应用案例及参数:(1)案例背景:客户使用逆转录获得的双链 cDNA(ds cDNA全长约 1.1kb,需酶切至 300bp 左右用于文库构建。(2)操作参数:Input DNA 量…
若使用本公司gDNA片段化产品按说明书酶切条件(20 min)酶切后仍未达到预期效果,建议优先排查以下问题:(1)DNA质量问题:Input DNA中若引入高浓度金属离子、螯合剂或其他盐离子,可能抑制酶活性。建议将 DNA稀释至ddH₂O或不含 EDTA 的10 mM Tris Buffer ((p…
在酶切反应中,即使酶切时间较短,仍可能出现过度酶切现象。例如,以300 bp 插入片段的白细胞基因组DNA(gDNA)为例,若采用30℃、10 min的酶切条件,可能会出现过度酶切现象。本产品建议在进行酶切时,需根据不同样本的基因组DNA大小调整反应条件。对于白细胞等基因组DNA相对较小的样本,应适…
酶切法建库过程中,需从多维度进行质量控制以确保文库质量,具体如下:(1)文库浓度检测:可采用Qubit荧光定量法或qPCR法,其中Qubit法通过特异性结合dsDNA的荧光染料实现浓度精准定量,qPCR 法则基于实时荧光定量原理,二者均能有效评估文库浓度; (2)文库长度检测:使用琼脂糖凝胶电泳(推…
本产品(片段化模块酶)是随机内切酶,属于单酶体系。(1)酶类型:为随机内切酶,可对DNA进行随机切割;(2)酶体系:单酶制剂;(3)应用范围:适用于DNA片段化(如用于二代测序文库构建等场景),但酶切后产生粘性末端,需后续进行末端修复。反应条件:建议初始投入量范围为500 pg 1000 ng,在3…
本试剂盒采用转座酶进行DNA 片段化,可将传统的DNA 片段化、末端修复及接头连接等繁琐步骤整合为一步酶促反应,仅需 10分钟即可完成。
12207 适用于构建以 50 ng 为起始量的 DNA 文库,13468 适用于构建以 1 ng 为起始量的 DNA 文库。两者的核心区别在于试剂盒中酶的浓度存在差异:酶浓度不匹配可能导致模板 DNA 片段化不完全或片段大小偏大,进而使最终文库与预期结果产生偏差。因此,强烈建议根据实际的 DNA …
使用本试剂盒(货号:12207)进行文库构建时,必须进行文库扩增步骤。原因在于转座反应产物并非完整的双链DNA 文库,需通过PCR 反应生成完整的DNA文库,以满足后续测序平台(如Illumina、MGI等)的建库要求。
本产品可以作用于PCR产物,但需保证PCR产物长度>500 bp。因转座酶无法作用于DNA末端,PCR产物最末端50 bp的测序覆盖度可能会有所降低。为避免末端测序覆盖度降低,推荐在制备PCR产物时将待测区域两末端各延长50-100 bp
产品12201 适用于 500 pg至500 ng的片段化DNA 样本。
本公司建库试剂盒通常不包含接头,接头产品单独设置货号。客户可根据实验平台(如Illumina、MGI等)及样本数量等需求,选择适配的接头产品。
12199ES 与 12201ES 建库试剂盒的核心区别在于扩增模块的设计。具体选择建议如下:(1)若需高产量扩增,推荐使用 12199ES 建库试剂盒,其扩增模块适配高效扩增需求,可提升样本中目标核酸的产量;(2)如后续实验对扩增保真度要求较高(例如进行单核苷酸多态性(SNP)检测等精准分析),则…
磁珠用量参考如下表(具体用量需根据实际建库体系体积及样本类型调整):(1)12199(Canace 血液基因组 DNA 建库试剂盒):建议磁珠用量为体系体积的 1.8 倍(例如 100 μL 体系需 180 μL 磁珠);(2)12200(Canace 唾液基因组 DNA 建库试剂盒):建议磁珠用量…
末端修复/加 A 步骤需开启热盖的原因如下:(1)末端修复反应体系中,部分酶促反应(如 Taq 酶介导的延伸反应)在 72℃ 高温下进行,若热盖关闭,反应过程中产生的冷凝液会回流至反应管内,导致反应体系体积损失或局部浓度变化,影响酶活性及反应效率;(2)接头连接反应通常在较低温度(如 16℃ 左右)…
针对FFPE样本建库,建议如下:(1)对于低质量FFPE样本,可使用石蜡样本修复试剂(Cat#12606)以优化文库质量。该试剂能在末端修复步骤中同步完成样本修复,无需额外实验操作,有助于提升文库产量。(2)操作时需注意严格按照产品说明书进行样本预处理及建库流程,确保实验条件(如温度、时间等)符合要…
1)末端修复/加 A:需使用 T4 DNA 聚合酶和耐高温 Taq 酶;2)T4 多聚核苷酸激酶(T4 PNK);3)接头连接:需使用 T4 DNA 连接酶;4)扩增模块:12201ES 对应的扩增模块为 12621/12624 高保真 DNA 聚合酶;12199ES 对应的扩增模块为 12620E…