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高通量测序产品技术咨询FAQ

Q:12201ES接头连接之后可以直接进行分选吗?

接头连接后**不可以直接进行分选**。原因是连接反应体系中含有的Ligation Enhancer(连接增强剂)内含高浓度PEG(聚乙二醇),PEG会对后续的分选过程造成显著干扰。因此,接头连接后若需进行片段分选,必须先通过纯化步骤(如使用磁珠法、柱纯化或乙醇沉淀等方法)去除Ligation Enh…

DNA建库 👁 37 🔖 12201ES, 分子类, NGS, DNA建库系列
Q:12201ES FFPE 样本修复试剂对建库具体的影响是什么?

FFPE样本修复试剂可针对石蜡样本的切口、缺刻及末端氧化情况进行有效修复。对文库构建的影响主要体现在:(1)可提升文库产量;(2)对测序质量(如Coverage等指标)无明显影响。需注意,该修复试剂的修复过程存在额外引入突变的可能性,因此肿瘤等样本的客户不建议使用。

DNA建库 👁 33 🔖 12201ES, 分子类, NGS, DNA建库系列
Q:RNA投入量是多少?投入的是什么RNA?能否将随机引物换成oligo dT?

1. RNA投入量:本产品适用于Total RNA 500 pg - 1 μg的投入量。2. 投入的RNA类型:可投入总RNA(Total RNA)。3. 引物替换建议:不建议将随机引物替换为oligo dT引物,可能会导致产量降低。若需使用oligo dT引物,需先分离mRNA后再进行逆转录反应。

RNA建库 👁 69 🔖 13488ES, 分子类, NGS, RNA建库系列
Q:可以使用12603ES直接从组织裂解液中分离mRNA吗?

不可以。12603ES试剂盒的设计用途为从总RNA中分离mRNA,若直接使用其从组织裂解液中分离mRNA,裂解液中的组分及杂质可能会对mRNA的分离效果产生干扰。建议先按照标准流程对组织裂解液进行预处理(如去除基因组DNA、沉淀蛋白等),或选择适用于直接从裂解液中分离RNA的试剂盒。

RNA建库 👁 67 🔖 12603ES, 分子类, NGS, RNA建库系列
Q:12257去除rRNA有残留?

针对12257产品去除rRNA过程中可能出现的残留问题,建议从以下两方面排查和优化:(1)RNase H Buffer与RNase H酶混合液的稳定性较差,建议在RNase H消化步骤中单独添加酶或现配现用混合液(配置完成后10分钟内使用完毕);(2)若混匀不彻底可能导致rRNA残留,建议使用振荡器…

RNA建库 👁 68 🔖 12257ES, 分子类, NGS, RNA建库系列
Q:mRNA 文库构建分为链特异性文库和常规文库,这两个文库的区别是什么?

mRNA文库构建中,链特异性文库与常规文库的核心区别在于第二条链合成时所使用的核苷酸类型:(1)常规mRNA文库:在合成第二条链时加入dTTP,(脱氧胸苷三磷酸);(2)链特异性 mRNA文库:在合成第二条链时加入dUTP(脱氧尿苷三磷酸)。通过此差异,链特异性文库可在文库构建过程中保留RNA的原始…

RNA建库 👁 71 🔖 12301ES, 分子类, NGS, RNA建库系列
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