两款产品是同一个酶切位点的同工酶,15203ES酶切效果更好,但价格相对较贵。15048ES相对酶切效果弱于15203,并且属于温度敏感型,使用和保存要谨慎,性价比较高。
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转化质粒的大小与菌株有关, DH5α和 Top10 感受态细胞适合小于 15kb 的质粒。
先用感受态细胞转到含抗生素的培养基中,如果不长,说明抗生素没有失效。在排除抗生素是否失效的原因后,检查转化步骤,在转化操作时,请勿将菌体全部涂布于平板上。因为大量菌体的存在抑制正常转化子的生长。改正的方法有两种:一是省去 37℃ 复苏培养的步骤,这样不但节省了时间,而且也不出现云雾了;二是 37℃复…
Amp 抗性板铺板密度过高或培养时间过长都会导致出现对 Amp 敏感的卫星菌落, 因此涂布 Amp 抗性板时菌密度应适当降低,同时 37℃培养时间不超过 20 h。另外推荐选择培养基中使用羧苄青霉素代替氨苄青霉素(Amp),并将抗生素浓度提高到 100µg/mL,可使情况改善。
转化质粒的大小与菌株有关, DH5α感受态细胞适合小于 15kb 的质粒。
11802属于普通速度转化的感受态细胞,需要42℃热激37℃孵育等步骤,而11803属于快速转化的感受态细胞,无需热激孵育。
a)设计原则:同源臂(15-25 bp,GC 含量 40-60%)+酶切位点(根据实验需求保留或删除)+基因特异性引物(常规插入片段扩增引物)。b)可以不引入。c)计算扩增引物退火温度时,只需计算基因特异性扩增序列的 Tm 值,引入的同源序列及酶切位点不应参与计算。
应避免选择克隆位点上下游 50 bp 内有重复序列的区域。并且克隆位点上下游 20 bp 区域内 GC 含量尽量在 40%-60%范围内。
原因 1:载体线性化不完全判断方法:将已制备的线性化的载体转化涂板,如果长克隆较多,则表示线性化不完全。解决方案:若线性化不完全则需优化酶切体系,例如提高限制性内切酶使用量、延长酶切反应时间、胶回收纯化酶切产物等,具体优化操作可参考限制性内切酶供应商的使用说明(通常推荐双酶切)。原因 2:反应体系中…
10922可组装片段最大可到23k,10923最大可至25k。另10923可做小体系低至6μL 。
采用载体通用M13引物,扩增出500多bp的条带。
氨苄和羧苄都可以,建议羧苄,因为氨苄失效比较快。
基于同源重组技术的定点突变系统。使用本试剂盒,目标质粒扩增产物经 DpnI 消化 同源重组环化后直接进行转化即可完成定点突变。
多点突变试剂盒可一步实现目标质粒上 3-5 个不连续位点的定点突变,而定点突变试剂盒是适合 1 或2 个不连续位点的定点突变。如:3 个连续的碱基突变算 1 个位点的突变,故定点突变试剂盒即可(相距超过 50 bp 为 1 个不连续位点)。
点突变过程需要去除模板质粒,防止假阳性。利用的原理就是限制性内切酶 DpnI 能消化甲基化的模板,若是非甲基化,则无法去除模板。
正反向扩增引物 5’端包含至少 20 bp 反向互补区域,各引物非互补区域长度至少为 20 bp。互补区尽量选择无重复序列,GC 含量尽量在 40%-60%范围内。
在不影响扩增产物的情况下,尽可能少的量(建议<1ng),避免DpnI 消化不完全。
最好进行胶回收。未消化完全的质粒或其他非特异性条带会影响后续的重组反应。
PCR 模板应为甲基化质粒,应使用甲基化酶无缺陷型的宿主菌扩增原始质粒(如DH5α,TOP10, JM109 等)。应尽量使用新鲜制备的质粒作为模板,因长期放置,反复冻融可能会导致模板质粒断裂,开环或降解。
小于 20 kb。质粒越大,其他非目的碱基的突变率越高,PCR 更难,重组效率更低。